2021年结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识发布，概要一览！

交膀胱癌在我国的发眼疾率呈随之下降的趋向，世于 界卫生其组织国际癌症研究机构(International Agency for Research on Cancer，IARC)数据显示，我国 2020 年交直 肝硬化的从新发眼疾例数为 56 万例，因交膀胱癌被害眼疾例高达 29 万例 。 约 25%的交膀胱癌眼疾人在检验时已出现几倍 附近分散，此外，25%的眼疾人在疗法不单是并作过程中所频发分散，晚期 眼疾人预后偏高，5 年生存率不身 15%。 分子多种类改型有无 量度是筛选小分子疗法授予益这群人的前提，近十年随着监量度 高效率的快速增长，脊椎动物信息学量度序，也称为下一代量度序( next generation sequencing，NGS)，因其在通量、成本及效率 等各个方面的综合官能优势，在癌症官能状官能状监量度中所展现出越 来越广阔的应当用前景。 然而 NGS 监量度高效率时序复杂， 对科学研究所环境前提条件、技术人员能力及数量级管理制度决定高，任何 一个环节出现解决办法，更会不良影响监量度交果的精确官能，进而不良影响临吊研究执行者。

为保障临吊研究医疗工并作的精确官能和规范化官能，本一致由临吊研究外科交合交膀胱癌择际医疗需求发起，传媒界诸多监量度公司进行，眼疾理及有无造专家学者导师，从交膀胱癌 NGS 监量度的临吊研究角度及科学研究所时序质控角度共同制订中所国专家学者一致，以导师 NGS 监量度高效率在交膀胱癌医疗中所的规范化应当用。

1，脊椎动物多种类改型在交膀胱癌中所的临吊研究意义

目前为止较确切的肝硬化特别口肾眼疾疾眼疾主要有 3 类:Lynch 综合官能征、后裔官能腺糙官能胆石眼疾 ( familial adenomatous polyposis，FAP）和黑斑胆石眼疾（P⁃J 综合官能征）。 同时《中所国临吊研究癌症学会 ( CSCO) 交膀胱癌医疗读物 2020 版》 针对肾眼疾交膀胱癌筛查和官能状检验制订了主张。

FAP 提拔同步进在行 APC 外显子量度序/片断有缺陷量度序，有官能状预设 FAP 或衰减改型 FAP(AFAP);无官能状 则提拔在行 MUTYH 外显子量度序 / 片断有缺陷量度序，有突 动预设 MUTYH 特别口胆石眼疾(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis，MAP)。 对于无任何已知的胆石眼疾综合官能征官能状 的仍要疫官能表征，首选多官能状官能状监量度，多官能状 Panel 应当包含所有胆石和交膀胱癌特别口官能状。

交膀胱癌中所少见 TMB 判读方法及监量度艾克里外汇总

TMB 监量度有助于帮助筛选仍要疫疗法潜在授予 益的眼疾人，显着提升晚期恶官能癌症眼疾人的合理缩 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 上会也伴随 TMB⁃H，MSI⁃H 癌症样品中所有约 83%表现为 TMB⁃H，且有 97%的样品 TMB≥10 Muts/ Mb。 在科学研究和择践不单是并作过程中所，TMB 的指标判读规范 在不同癌种中所依赖于差异，而不同小分子量度序 Panel 的 TMB 监量度体系相互间 TMB 持续性不能国际标准。

眼疾人制订特别口疗法方案的不单是并作过程，交合交膀胱癌脊椎动物多种类改型特别口临吊研究意义，同意监量度并作如下提拔 ：

2，样品管控及转运

FFPE 样品为保障碱基数量级，手术或活有无

其组织应当在离体 30 min 内浸入到 100 ml 的 4%甲 醇和溶解中所同步进在行相同，避仍要常用酸官能及成份重金属 镁的相同液。 其中所，大标本相同等待时间为 6 ~ 48 h，不超过 72 h;小活有无体可相同 6 ~ 12 h。 对 其中所 1 张 FFPE 样品同步进在行腌上色，并在显微镜 下观察癌症蛋白的浓度和数量。 若癌症浓度不 身，则科学研究所能够对通过富含后相符数量级决定的 标本同步进在行指标，或者制备成 FFPE 蛋白学蜡块后 同步进在行碱基提先取。 值得注意的是，积极开展 NGS 监量度前 应当通过 HE 上色指标癌症蛋白浓度，有数满身肿胀 糙蛋白浓度在 20%以上。

手术或活有无的水果其组织样品

水果其组织可提先取到高数量级的碱基。 水果其组织应当在离体 30 min 内 将其遗留于液氮罐或者-80 °C 烤筒中所，防止 RNA 等 碱基分解。 如需指标癌症蛋白浓度，可须以用无菌切 片上色体方法，若癌症蛋白浓度不身，可通过标上 癌症范里外内同步进在行富含。 水果其组织可在液氮、-80 °C 冰河 筒或稳定剂中所长期遗留。

肝脏样品

对于依赖于于肝脏中所的循环 DNA， 即 ctDNA，先取样时可常用专用的 ctDNA 遗留管须以血， 须以血后轻柔颠倒 8 ~ 10 次，适当须以微血管中所的 ctDNA 遗留液与肝脏充分混匀，无定形转运遗留即可，违者 冻融肝脏;到高达科学研究所后，复合肝脏，提先取中性 DNA[26] 。 也可常用了了 EDTA 抗凝汽化须以微血管， 热带植物 8 ~ 10 ml 全血，冷藏运欠，2 h 内复合肝脏，提 先取中性 DNA，如需遗留，请求放到-80 °C 烤筒中所，并避 仍要间歇冻融。

样品运还给规范化

还给规范不单是并作规范化( SOPs) 以适当运还给不单是并作过程中所各类样 本的安全官能和不单是并作过程的可控官能(详见第 4 节)。 聚乙烯 胶合板可以无定形运欠，肝脏样品能够在干冰河前提条件下运 欠，碱基样品需在 4 °C或无菌前提条件下运欠。

3，简报暗示及规范codice_

NGS 临吊研究简报包含素材

官能状监量度的临吊研究报 告必要包含:(1)基础数据:科学研究所英文名称、科学择造不单是 并作技术人员、简报审核技术人员、联系手段。 (2)受有无者的 大体数据:应当包含受有无者姓名、官能别、真名、 接受监量度的日期、监量度的目的和受有无者的临吊研究指 征等。 (3)样品的数据:样品改型式，如 DNA、外周血、唾液、水果其组织、FFPE 其组织等;热带植物等待时间和须以 集口腔、样品编号、还给有无等待时间、监量度简报等待时间和样 本主要质控情况，如 DNA 数量级指标以及量度序质 量指标等。 (4)监量度从新项目:官能状 Panel 的监量度位 点及 有无 量度 艾克 里外、 有无 量度 星象 器、 有无 量度 初授 剂， 是 否 为 NMPA 批准常用的监量度初授剂以及 NMPA 授予批的 官能状底物数据，或科学研究所自辟监量度( laboratory de⁃ veloped tests，LDTs) 初授剂、监量度方法、监量度艾克里外、有无 量度下限(LoD)等。 (5)监量度交果及表征暗示:对 官能状表征的监量度交果同步进在行暗示，如有无出的官能状 改型、表征交果、上色体动化情况、监量度交果的仍要疫 官能PG、药品数据及临吊研究意义、表征暗示重述的 简介古论著等。 (6)标注监量度方法的科学研究所内部造 证交果，监量度局限官能及复杂官能，进一步监量度的 同意。

官能状表征的命名

对官能状表征的揭示应当遵循 一定的主张和规范化，提拔常用进化官能状组表征协会 命名读物(www.hgvs.org)，RNA本的自由选择同意须以用官能状座简介官能状组序列数据库系统( Locus Reference Ge⁃ nomic， https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 下定义的RNA本或者多个国际数据库系统公认的主要RNA本。 对肾眼疾交膀胱癌特别口官能状表征的说明，同意以英国医学遗传学医学院( American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG;https:/ / www.acmg.net)读物为规范，在监量度交果中所请求注意具体的表征底物数据，包含官能状英文名称、所简介的进化官能状组测初授版、RNA本简介序列测初授版、核苷酸表征、氨基酸表征、外显子 / 真核脊椎动物序号、等位官能状杂合官能、上色体编号及坐标等等。

临吊研究意义的暗示和批注

对于癌症生殖蛋白官能状，须以用PG管控的手段 综合官能伴随检验、临吊研究读物、数据库系统或古论著证词，可 以将癌症生殖蛋白官能状官能状包含临吊研究意义确切(I 级)、有潜在临吊研究意义(II级)、临吊研究意义不确切(III 级) 和良官能或可能良官能官能状( IV级) 。 科学研究所能够创辟分类及PG和简报的 SOPs，SOPs 应当有数包含两 个各个方面:(1) 对生殖蛋白官能状官能状同步进在行PG的时序; (2)在日常监量度中所简报哪一级或哪几级官能状底物。 PG的时序应当有记录，包含证词相关联的读物、古论著、 数据库系统、证词类别、PG交果等。 临吊研究证词暂时突 动底物PG，可根据《脊椎动物信息学量度序高效率临吊研究规范化化 应当用北京专家学者一致》刊发的生殖蛋白官能状底物和临 吊证词包含以下 4 级。

对胚系官能状的监量度

除了中所外医疗读物及 重要简介古论著外，另有 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和英国 ACMG 可简介。 ACMG 读物将表征底物仍要疫官能的类别包含仍要疫、唯 似仍要疫、临吊研究意义未明、唯似良官能和良官能 5 个类别。 简报中所应当请求注意与肾眼疾交膀胱癌(如 FAP、Lynch 综 合征等)特别口的仍要疫以及唯似仍要疫表征，并对表征 的仍要疫官能同步进在行分析暗示[28] 。

意义推断底物的管控

无论是癌症生殖蛋白 官能状，或是胚系官能状，都依赖于意义推断底物。 科学择造 四楼需制订特别口政策用来确定是否是简报或者不简报 临吊研究意义推断的底物，并作成说明和简介数据库系统， 并且要在简报中所注明本科学研究所出有临吊研究简报的 规则。

DPYD 监量度交果

中所等分解改型眼疾人，应当基于 活官能百分比减缓起始口服;慢分解改型应当避仍要常用氟尿嘧 内酯及其前体药品。 UGT1A1 监量度交果中所，UGT1A1∗28 和∗6 为纯合表征改型或双杂合表征改型的眼疾人应当减缓 伊立替康的口服，提拔口服为 150 mg / m2 。

低原子量官能状交果的管控

对样品同步进在行 NGS 有无 量度时如出现较低原子量的官能状交果( 上会其组织学样品少于 5%，肝脏样品少于 1%或少于监量度 LoD)时，辟 议综合官能指标 NGS 科学择造平台官能能、量度序高度以及癌症 蛋白比率等因素综合官能考虑。 特别对于小分子疗法相 关口的官能状同意常用其他监量度方法同步进在行进一步造证 确认(如 Sanger，dPCR 等)。

可唯拒绝

同意提供眼疾人手写或者在线版的可唯论著。

简报codice_

科学研究所应当根据监量度从新项目，给出相关联当 的监量度简报codice_(表 7)，并形成 SOP 档案。 codice_中所 应当确切请求注意监量度简报中所应当提供的数据，如眼疾人大体 数据、样品数据、监量度数据、监量度交果、交果暗示、择 造四楼数据、监量度方法的局限官能以及其他素材等。

早期出附近

中所国抗癌协会癌症小分子疗法专业特别委员会.交膀胱癌分子监量度脊椎动物信息学量度序中所国专家学者一致 .临吊研究癌症学从新闻周刊 2021 年 3 年末第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology，Mar. 2021，Vol.26，No.3